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• siRNA药物会呈现靶mRNA被沉默后的生物学效应，由此引发的其他效应是可能的，但一般不易观察到。
• 由于siRNA核酸序列设计的专一性，与非靶mRNA结合的效应很少见。
• 由于RISC作用的高效性，较少见到siRNA抢夺其它miRNA资源的情况。
• 很多毒性反应与siRNA药物在给药部位、组织、细胞残留或畜积相关，例如给药部位的炎性反应、肝细胞空泡变性、肾小管空泡变性及嗜碱性颗粒沉积等。
• 还有一些毒性反应是与siRNA药物排泄过程相关。
• siRNA具有诱发先天性和取得性免疫反应的潜能，但在常规非临床安全性研究中，这种效应通常不明显。
• 虽然可能会出现免疫原性，但抗原不一定就是siRNA本身。制剂辅料或结构组分也可能引起免疫反应，例如，如果含有PEG（聚乙二醇），则容易产生抗PEG抗体。
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